ناضلت الدول الاجنبية طيلة قرون من اجل السيطرة على ألبانيا،‏ الامر الذي ادى الى خلافات دينية.‏ وفي اوائل القرن السادس عشر كانت المنطقة منقسمة دينيا،‏ بحيث اعلن البعض انتماءهم الى المسلمين وآخرون الى الارثوذكس وغيرهم الى الكاثوليك.‏

بعد ذلك،‏ ازالت سياسة الحكومة ممارسة الدين المنظَّم.‏ وعقب الحرب العالمية الثانية،‏ ألغت السلطات الشيوعية الدين برمته،‏ وأعلنت ألبانيا اول بلد ملحد في العالم.‏