وما هي الا ايام قليلة حتى غادر إملِن مدينة دبلن في ايرلندا متجها الى انكلترا.‏ ولكن بعد عشرة اسابيع،‏ عاد ادراجه الى دبلن كي يسوّي بعض المسائل العالقة بنيّة الاستقرار في لندن.‏ وفيما هو هناك،‏ نشر كتابه بحث متواضع في رواية الاسفار المقدسة عن يسوع المسيح (‏بالانكليزية)‏ آملا ان يدافع عن قناعاته.‏ وفي هذا الكتاب،‏ قدّم اثباتات واضحة من الاسفار المقدسة تؤكد لمَ لا يعقل ان يكون يسوع الاله الاسمى.‏ فأثار ذلك حنق اعضاء من جماعته السابقة في دبلن وقدّموا شكوى بحقه.‏

فاعتُقل إملِن ومثَل في ١٤ حزيران (‏يونيو)‏ ١٧٠٣ امام محكمة مجلس الملكة الخاص في دبلن.‏ يذكر في كتابه سرد دقيق لوقائع الجلسة (‏بالانكليزية)‏:‏ «كانت تهمتي تدوين ونشر كتاب زعموا اني اؤكد فيه .‏ .‏ .‏ بتجديف وخبث ان يسوع المسيح ليس مساويا للّٰه الآب».‏ وفي الواقع،‏ لم تكن المحاكمة سوى مهزلة.‏ فسبعة من اساقفة كنيسة ايرلندا جلسوا الى جانب القضاة على منصة القضاء.‏ ولم يُسمح لإملِن ان ينبس ببنت شفة دفاعا عن نفسه.‏