ولكن تحت حكم اخيه الكسندر جانيوس،‏ الذي امتد من ١٠٣-‏٧٦ ق‌م،‏ كان ان بلغت السلالة الحشمونية اوج قوتها.‏

فقد رفض الكسندر جانيوس السياسة السابقة وأعلن نفسه رئيس كهنة وملكا على السواء.‏ فازدادت حدة الصراعات بين الحشمونيين والفريسيين،‏ مما ادى الى اندلاع حرب اهلية تسببت بموت ٠٠٠‏,٥٠ يهودي.‏ وبعد قمع الثورة،‏ قام جانيوس بعمل يذكِّر بما كان يفعله الملوك الوثنيون.‏ فقد علَّق ٨٠٠ من الثوّار،‏ الذين ذُبحت زوجاتهم وأولادهم امام عيونهم وهم يحتضرون،‏ فيما كان جانيوس يقيم احتفالا مع سراريه.‏b

ولكن رغم عداوة جانيوس مع الفريسيين،‏ كان واقعيا في سياسته.‏ فقد رأى ان دعم الشعب للفريسيين يزداد.‏ لذلك اوصى زوجته سالومي الكسندرا وهو على فراش الموت ان تتشارك معهم في السلطة.‏ فقد اختارها بدلا من ابنائه كخليفة له على مملكته.‏