天主教历史家尼科利诺·萨拉莱说，若望保禄二世的“‘自我批判’计划是个策略，要达到的目的是普世教会联合”。

可是，教会请求恕罪并不仅为了这个理由。今天，基督教国的可耻记录已广为人知。神学家汉斯·乌尔斯·冯·巴尔塔扎说：“教宗所隶属的教会做了和获准做了不少的事，是我们今天无法认可的。”因此，教宗设立了一个委员会“去为教会历史黑暗的一面作个交代，……好向世人请求恕罪”。教会愿意自我批判的另一个理由看来是，教会想恢复受尊重的道德地位。

并非人人都认为教会应当公开请求恕罪。例如，教宗为贩卖奴隶一事请求恕罪，同时恢复了像胡斯和加尔文等异见分子的地位，一群罗马天主教徒就为此感到不安。据梵蒂冈消息透露，教宗在发给枢机主教的文件中建议，教会对过去1000年来的天主教历史作一番“良心上的检讨”。这份文件被出席1994年6月举行的教会议会的枢机主教大事批评。可是，教宗坚持要把这个建议的内容加入一份通谕里，但意大利枢机主教贾科莫·比菲却在他所发出的牧函中坚称：“教会无罪。”然而他承认：“为过去多个世纪神职人员的过犯请求恕罪，……可以使天主教会在一般人眼中有个较好的形象。”

梵蒂冈评论员路易吉·阿卡托利说：“悔罪是天主教会内最具争议性的问题之一。如果教宗承认传教士的罪行，有些循规蹈矩的传教士自然会感到不悦。”此外，一位罗马天主教作家写道：“如果教宗真的认为教会历史这样可怕，我们实在很难理解，他又怎么把同一个教会誉为‘人权’的杰出倡导者和我们的‘母亲兼导师’，带领人类走向真正光明的第三个一千年。”

关于教宗屡次发表的自我批判，枢机主教比菲语带讽刺地问道：“对于以往所犯的罪行，我们等候世界大审判来临不是好得多吗？”审判全人类的日子即将来临了。耶和华上帝清楚知道宗教的黑暗历史。他很快就要跟一切作恶的人算账。（启示录18:4-8）