完成救濟的任務之後，兩人於公元47年左右回到安提阿，接著在聖靈指引下踏上傳道旅程。巴拿巴和保羅首先前往塞浦路斯，在那裡向行省總督士求·保羅傳講上帝的真理。

但兩人因該不該帶馬可（又叫約翰）同行而起了衝突，他們就分道揚鑣，各自到不同的地區傳道。巴拿巴帶著表弟馬可往塞浦路斯，