他的弟弟亞歷山大·傑尼爾斯繼承王位，從公元前103年一直統治到公元前76年。這時哈斯蒙王朝達到全盛時期。

亞歷山大·傑尼爾斯棄用前人政策，公開宣布自己是大祭司兼君王。哈斯蒙王朝和法利賽派之間的衝突因此加劇，甚至引發內戰，結果有五萬個猶太人喪生。叛亂平息後，傑尼爾斯仿效異教君主的做法，把八百個叛亂分子掛在柱上b，又當著垂死的叛徒面前，殺害他們的妻子和兒女。傑尼爾斯在場大擺筵席，公然和妃嬪吃喝玩樂。

傑尼爾斯儘管敵視法利賽派，但畢竟是個講究實際的政治家。他看出法利賽派越來越受民眾歡迎，所以臨終囑咐妻子莎樂美·亞歷山德拉，要跟法利賽派攜手合作，鞏固王朝的勢力。傑尼爾斯讓妻子繼位，不把王位傳給兒子。