每年只有一天（在贖罪日那天），大祭司可以進入聖幕或聖殿的至聖所。（來9:7；利16:2,12,14,15）

之後，大祭司要拿芬芳的香末及從壇上用火盤盛滿燒紅的火炭，帶進帷幔內，進入至聖所。聖諭櫃就放在這個內室，用純金做的櫃蓋上有兩個用金子做的基路伯天使像。在這個內室，大祭司要用火燒香，使香的煙雲繚繞，籠罩聖諭櫃蓋。（利16:12,13；出25:17-22）亞倫這樣做是要讓自己可以再次進入至聖所而不致滅亡。

亞倫從至聖所出來，要拿些公牛的血帶進內室，用指頭把血灑在約櫃蓋前朝東的地方，一連七次，為祭司團贖罪。（利16:14）這樣，祭司們就潔淨了，能夠做耶和華和人民之間的居間人。

然後把「歸於耶和華」的山羊的血帶進至聖所，為非祭司部族的以色列十二部族贖罪。大祭司把羊血帶進帷幔內，像灑公牛的血一樣，「對著約櫃的蓋，把血灑在櫃蓋前」。（利16:15）

使徒保羅也指出，大祭司一年一度帶著祭牲的血進入至聖所，預示耶穌基督帶著自己的血到天上去，為所有對他的犧牲表現信心的人贖罪。當然，耶穌既是無罪的，就不必像以色列的大祭司那樣，需要為自己的罪獻上祭牲。（來9:11,12,24-28）

亞倫為祭司和其他利未人獻上公牛做贖罪祭，把血灑在至聖所裡。（利16:11,14）同樣，基督降世為人，將自己的血的價值帶到天上獻給上帝，造福那些跟他一起做祭司和君王的人。（啟14:1-4；20:6）「歸於耶和華」的山羊也被獻做祭牲，羊血被灑在至聖所的約櫃前，為非祭司部族的以色列民造福。（利16:15）同樣，耶穌基督一次的流血犧牲，就不但使擔任祭司的屬靈以色列受益，也讓全人類得益不淺。