這種宗教遺產並沒有為這個國家帶來和平。戰爭不但大大影響巴拉圭的發展，也在人民生活上留下了很深的創傷。從1864年至1870年，巴拉圭在弗朗西斯科·索拉諾·洛佩斯領導下，跟巴西、阿根廷和烏拉圭三國交戰，結果損失慘重。據現有的記錄透露，在戰爭起頭，國內人口可能有100萬人或甚至更多。戰事結束時，據稱全國只剩下22萬人，其中至少有19萬人是婦孺。之後還有別的戰爭接踵發生，其中一場戰爭是由於與玻利維亞爭奪查科地區的擁有權而發生的，其他的戰爭則由政治不穩所引發。因此，在巴拉圭，難怪一般想奪取權力的野心家時常使用暴力去達成自己的目的。

1932年，巴拉圭捲入了另一場戰爭，這次交戰的對手是玻利維亞。國家的人力再次大受打擊，國家的經濟連帶受到影響，從外國前來宣揚好消息的人的安全也受到威脅。