最後，主要的拉比學院從巴勒斯坦遷往提比里亞。其他的重要學院則設於齊波里、凱撒里亞和利達。可是日漸衰退的經濟情況，不穩定的政局，加上叛道基督教的壓力和迫害，促使許多猶太人遷徙到東部的另一個猶太人聚居地——巴比倫。

到公元4世紀末和5世紀初，巴勒斯坦猶太人的景況變得分外困難。叛道的基督教國勢力日大，不斷對猶太人加以禁制和迫害，最後，約莫在公元425年，政府下令解散猶太公會，同時取消納西（族長）的職位。由於這緣故，巴勒斯坦的阿莫拉恩合力編製了學院辯論的摘要，目的是要把有關記錄保存下來。這部著作在公元4世紀的後半部匆匆編纂完成，後世把它稱為《巴勒斯坦塔木德》。b

兩部《塔木德》——兩者有什麼差異？

希伯來語「塔木德」的意思是「研究」或「學問」。巴勒斯坦和巴比倫的阿莫拉恩學者專門研究、分析《密西拿》。兩部《塔木德》（巴勒斯坦和巴比倫）都作這種研究和分析，但兩者有什麼差異呢？雅各布·諾伊內爾寫道：「頭一部《塔木德》分析事實，第二部《塔木德》審核各種假設；第一部的內容囿限於與問題有關的範圍內，第二部則完全超越這些範圍。」

由於《巴比倫塔木德》編寫得較仔細和較完整，它的篇幅不但較大，而且思想和分析的手法也較深入、較透徹。每逢提到「《塔木德》」，通常所指的是《巴比倫塔木德》。許多世紀以來，人們研究和評述最多的正是這部《塔木德》。諾伊內爾認為，如果《巴勒斯坦塔木德》「是有分量的作品」，《巴比倫塔木德》就是「天才的傑作」了。