Poco después de que los nazis ocuparan Austria, el gobierno emitió una orden que requería que todos los que habían hecho el servicio militar durante la primera guerra mundial participaran en tres días de ejercicios de instrucción militar. Por lo tanto, se notificó a Johann Rainer que debía presentarse en el cuartel de Innsbruck.

¡Qué espectáculo! Ochocientos hombres en posición de firmes estaban a punto de prestar el juramento militar. Delante de todos ellos, el hermano Rainer se negó a hacerlo. Sin más dilación, fue llevado a una habitación para ser interrogado. Al salir, vio al capellán, llamado Klotz, vestido con su uniforme de militar, con un gran crucifijo que le pendía del cuello y muchas medallas en el pecho que le fueron concedidas durante la primera guerra mundial. Tras saludar con un “Heil Hitler!”, el clérigo abordó al oficial para darle su opinión sobre el hermano Rainer.

Algún tiempo después, el hermano Rainer fue conducido de nuevo ante varios oficiales para seguir interrogándole. Uno de los oficiales dijo que lo que el sacerdote y el hermano Rainer les habían contado no concordaba. El hermano Rainer contestó que en el capítulo 23 de Mateo podían leer lo que Jesús dijo acerca de semejantes líderes religiosos, a saber, que eran hipócritas. Otro oficial se puso de su parte. “¡Ese hombre tiene razón!”, dijo. No obstante, el hermano Rainer fue encerrado, y su caso remitido a la Audiencia Provincial. Llegado ese momento, la propietaria del negocio de venta de alimentos al por mayor en el que trabajaba Rainer se puso en contacto con el jefe de policía, quejándose de que no tenía a nadie que hiciera el trabajo del hermano Rainer. De manera que se le permitió volver con su familia y seguir en su empleo.

Johann Rainer rehusó prestar el juramento militar;