Durante este mismo período, la religión judía se dividió en facciones rivales. Los fariseos enseñaban que Dios había dado a Israel una ley doble, parte escrita y parte oral, y fue sobre la base de esta ley oral que reconocieron la legitimidad de la línea sumo sacerdotal incluso después de haberse interrumpido la línea tradicional.

Puesto que los saduceos ya no existían como grupo activo y los esenios simplemente habían desaparecido, los fariseos surgieron como los líderes indiscutibles. Ellis Rivkin, de la Hebrew Union College, explica la influencia que ejercieron. “La ley oral de los fariseos dio origen a la Mishna, al talmud palestiniano y al babilonio, a la responsa gaónica, medieval y moderna, así como a los diversos códigos de la ley judía.” The New Encyclopædia Britannica añade: “Incluso hoy día, todos los diversos grupos judíos, sean ortodoxos, conservadores o reformistas, afirman ser descendientes espirituales directos de los fariseos y de los sabios rabínicos”.