Mas no que se refere à religião, vemos um quadro bem diferente. Os maias eram politeístas; eles adoravam os deuses do Sol, da Lua, da chuva e do milho, entre muitas outras coisas. Seus sacerdotes eram observadores assíduos das estrelas. Sua adoração incluía o uso de incenso e imagens, automutilação, ritual de derramamento de sangue e a prática de sacrifícios humanos — de prisioneiros, de escravos e especialmente de crianças.

Falando sobre os maias da atualidade, o livro The Mayas—3000 Years of Civilization (Os Maias — 3.000 Anos de Civilização) diz: “Os maias veneram seus antigos deuses da natureza e seus ancestrais nos campos, nas cavernas e nas montanhas . . . e ao mesmo tempo adoram santos nas igrejas.” Assim, o deus Quetzalcoatl, ou Kukulcán, equivale a Jesus, e a deusa-lua, à Virgem Maria. Além disso, a adoração da árvore sagrada sumaúma foi substituída pela veneração da cruz, que as pessoas ainda regam como se fosse uma árvore viva. Em vez de mostrar representações de Jesus, as cruzes são decoradas com flores de sumaúma.