В молитвах, записанных на нескольких призмах, Набонид просит бога луны за себя и за своего первенца, Валтасара (Documents From Old Testament Times / Под ред. D. W. Thomas. 1962. С. 73). Как видно из одной надписи, в третьем году своего царствования, прежде чем отправиться в поход, во время которого была завоевана Тема (Тейма; библ. Фема) в Аравии, Набонид поручил правление в Вавилоне Валтасару. Согласно той же надписи, вавилоняне были недовольны тем, что Набонид выдвигал на первое место культ бога луны и не приходил в Вавилон, чтобы праздновать Новый год. В хронике Набонида в связи с 7, 9, 10 и 11-м годами его царствования каждый раз говорится, что царь был в Теме, и повторяется следующее: «Царь не приходил в Вавилон [для празднований в месяце нисане], [истукан] Набу не приходил в Вавилон, [истукан] Бела не выносили [из Эсагилы в торжественной процессии], праздник Нового года не справлялся» (цит. по: Тураев Б. А. История Древнего Востока. Мн., 2002. С. 508). Части хроники, в которых говорится о других годах, сильно повреждены, и поэтому сведения о них неполные.

О городе-оазисе Тема в одном тексте говорится: «Город он украсил... они сделали его [дворец] подобным дворцу в Вавилоне» (Хрестоматия по истории Древнего Востока. М., 1980. Ч. 2. С. 22). Судя по всему, Набонид сделал Тему своей резиденцией, и из древних надписей видно, что караваны верблюдов доставляли туда продовольствие из Вавилонии. Управление Вавилоном Набонид доверил Валтасару, хотя при этом сохранил за собой положение верховного правителя. Поскольку Тема располагалась на пересечении караванных путей, которые проходили через Аравию и по которым перевозили золото и пряности, интерес Набонида к этому городу мог быть обусловлен экономическими причинами. Или же его могло привлекать то, что город занимал стратегически выгодное положение в военном отношении. Предполагают также, что Набонид решил управлять Вавилоном через сына из политических соображений. Другими возможными причинами, почему Набонид отдавал предпочтение Теме, могли быть здоровый климат тех мест, а также широкое распространение в Аравии культа бога луны.

О деятельности Набонида между 12-м и последним годом его правления ничего не известно. Предчувствуя угрозу нападения мидо-персидских войск во главе с Киром Великим, Набонид заключил союз с Лидийским царством и Египтом. Согласно хронике Набонида, в год вторжения мидян и персов Набонид находился в столице. Туда привезли идолов богов разных вавилонских городов и провели празднование Нового года. О военных действиях Кира в том же документе говорится, что после победы в Описе он захватил Сиппар (ок. 60 км к С. от Вавилона) и что тогда «Набонид бежал». Далее в хронике сообщается о захвате Вавилона мидо-персидскими войсками и говорится, что, «когда Набонид отступил, он был схвачен в Вавилоне» (Там же. С. 18). Согласно Беросу, вавилонскому жрецу, жившему в III в. до н. э., Набонид выступил против Кира и сразился с ним, но потерпел поражение. Затем, по словам Бероса, Набонид укрылся в Борсиппе (к Ю.-Ю.-З. от Вавилона), а после падения Вавилона сдался Киру и был выслан в Карманию (юж. Персия). Рассказ Бероса согласуется с 5-й главой библейской книги Даниила, в которой говорится, что во время гибели Вавилона обязанности царя исполнял Валтасар.

По поводу отсутствия имени Набонида в 5-й главе Даниила стоит заметить, что Даниил очень мало пишет о событиях, происходивших непосредственно перед захватом Вавилона, и описывает крах империи буквально в нескольких словах. Тем не менее косвенное упоминание о правлении Набонида есть в Даниила 5:7, 16, 29. В этих стихах Валтасар обещает сделать Даниила третьим правителем в царстве, подразумевая, что Набонид был первым, а сам Валтасар вторым. Вот как это комментирует профессор Р. Ф. Дохерти: «То, что в пятой главе книги Даниила нет упоминаний о Набониде, согласуется с известными фактами, ведь Набонид, очевидно, не принимал участия в событиях, происходивших после того, как Гобрий [возглавлявший войска Кира] вошел в город» (Nabonidus and Belshazzar. С. 195—196, а также 73, 170, 181).

Примечательно, что, хотя в хронике Набонида имя Валтасара прямо не упоминается, в ней содержатся явные указания на него. В свете сказанного во втором столбце, строках 5, 10, 19, 23, ассириолог С. Смит пришел к выводу, что в строке 8 первого столбца было написано о том, что Набонид доверил царство Валтасару, сделав его своим соправителем (Smith S. Babylonian Historical Texts: Relating to the Capture and Downfall of Babylon. Лондон, 1924. С. 100). В хронике неоднократно повторяется, что сын царя был в Аккаде, то есть в Вавилонии, а сам царь — в Теме, которая находилась в Аравии. Хотя в тексте имя Валтасара не упоминается и в нем ничего не говорится о его смерти, это ни в коем случае не ставит под сомнение достоверность боговдохновенной книги Даниила, в которой имя Валтасара появляется восемь раз и пятая глава которой, ярко повествующая о падении Вавилона, завершается его смертью. Кроме того, специалисты в области клинописи признают, что объем хроники Набонида очень мал и к тому же, как уже отмечалось выше, она была составлена с целью опорочить Набонида, а не представить подробное описание событий. Вот что отметил в своем труде о Набониде и Валтасаре профессор Р. Ф. Дохерти: «Можно сказать, что библейское повествование превосходит все другие источники, потому что в нем упоминается имя Валтасара» (курсив наш.— Ред.) (Nabonidus and Belshazzar. С. 200).