Но своего расцвета хасмонейская династия достигла во время правления брата Аристовула, Александра Янная (103—76 годы до н. э.).

Александр Яннай изменил политический курс и открыто объявил себя царем и первосвященником. Конфликт между Хасмонеями и фарисеями обострился и даже вылился в гражданскую войну, в которой погибло 50 000 евреев. После подавления восстания, уподобляясь языческим царям, Александр Яннай распял 800 повстанцев. На глазах у умиравших мятежников казнили их жен и детейb. Яннай же в это время открыто пировал со своими наложницами.

Несмотря на свою ненависть к фарисеям, Яннай был прагматичным политиком. Он видел, что влияние фарисеев в обществе растет. Перед смертью он советовал своей жене Александре Саломее разделить власть с фарисеями. Яннай предпочел передать престол ей, а не своим сыновьям.