När Barnabas och Paulus var klara med hjälparbetet återvände de till Antiokia omkring år 47, och därifrån begav de sig sedan ut på en missionsresa under ledning av den heliga anden. Först kom de till Cypern, där de medverkade till att prokonsuln Sergius Paulus fick lära känna Guds sanning.

Men eftersom de inte kunde komma överens om huruvida de skulle ta med sig Johannes Markus eller inte, skildes de åt och reste åt var sitt håll. Barnabas tog med sig sin kusin Markus till Cypern,