Galilei skrev då boken Dialog om de två världssystemen. Även om påven hade beordrat honom att vara neutral, var det tydligt att han med sin bok tog ställning för Copernicus. Snart menade Galileis fiender att boken gjorde narr av påven. Galilei blev anklagad för kätteri, hotades med tortyr och tvingades att avsvära sig all tro på den kopernikanska läran. År 1633 dömde inkvisitionen honom till livstids husarrest och bannlyste hans böcker. Galilei dog i sitt hem i Arcetri nära Florens den 8 januari 1642.