Güney Çin’deki zengin Song Hanedanı’na yapılan saldırılar zaferle sonuçlandı. Kubilay Han kendini yeni bir Çin hanedanı olan Yuan Hanedanı’nın kurucusu ilan etti. Onun yeni başkenti bugün Pekin olarak bilinir. Kubilay, 1270’lerin sonlarında Song Hanedanı’nı savunan son birlikleri de yendikten sonra, 907’de Tang Hanedanı çöktüğünden o zamana dek ilk defa birleşen Çin üzerinde hüküm sürmeye başladı.

Çin’de ise iktidar kavgaları Kubilay’ın torunlarının otoritesini zayıflattı. Beceriksiz yöneticilerden, yolsuzluktan ve yüksek vergilerden bıkan Çinliler, 1368’de Yuan yönetimini devirerek onları Moğolistan’a dönmeye zorladılar.